基于蛋白质组学的乳腺癌标志物筛选及其应用

Screening breast cancer biomarkers through proteomics analysis

邓克瑜1; 赵莉1; 高琳; 黄静怡; 赵盼; 吴伟晴1

2022

中国现代医生   Impact Factor & Quartile

1673-9701

目的 利用高通量质谱技术筛选不同亚型的乳腺癌发生发展及预后标志物,有助于建立更有效的乳腺癌诊断手段、预测病因及干预治疗.方法 选取4例乳腺癌患者标本,包括4例癌组织和4例对应癌旁组织,采用SDT裂解法提取蛋白质,并BCA法进行蛋白质定量后,进行肽段的脱盐及定量.随后进行色谱分级、液相色谱–串联质谱(liquid chromatography–tandem mass spectrometry,LS–MS/MS)数据采集.用软件MaxQuant进行查库鉴定及定量分析.提取样本RNA经qPCR筛选出乳腺癌差异表达标志物.结果 分析4例乳腺癌样本的蛋白质组定量分析数据最后筛选出LCP1、ARF1、CCT3、VDAC1、NANS、NME1等23个癌组织中特异性表达的蛋白.且将相关蛋白所对应的基因与其癌旁进行比较筛选出在侵袭性乳腺癌癌组织中表达升高的23个基因.qPCR的结果表明最后有14个基因差异有统计学意义.结论 通过筛选及分析包括以下一种:LCP1、CCT3、NANS、NME1、HSP90AA1、RAN、YWHAZ、ERH、PRDX1、STIP1、HSPA8、H2AFY、HSPE1和PDIA3标志物.利用这些标志物在乳腺癌癌组织及癌旁组织的差异表达,可用于乳腺癌诊断、预后评估.

乳腺癌 肿瘤标志物 生物信息 蛋白质组学 基因差异表达

Chinese

First

广东省自然科学基金 ; 深圳市科创委基础研究面上项目 ; 国家自然科学基金

WanFang

zwkjzlml-yyws202220010

1.深圳市人民医院健康管理中心 暨南大学第二临床医学院 南方科技大学第一附属医院,广东深圳 518020
2.深圳市人民医院临床医学研究中心 暨南大学第二临床医学院 南方科技大学第一附属医院,广东深圳 518020

邓克瑜,赵莉,高琳,等. 基于蛋白质组学的乳腺癌标志物筛选及其应用[J]. 中国现代医生,2022,60(20):40-45,50.

邓克瑜,赵莉,高琳,黄静怡,赵盼,&吴伟晴.(2022).基于蛋白质组学的乳腺癌标志物筛选及其应用.中国现代医生,60(20),40-45,50.

邓克瑜,et al."基于蛋白质组学的乳腺癌标志物筛选及其应用".中国现代医生 60.20(2022):40-45,50.